熒光顯微鏡原理是通過激發(fā)式光源，將光學(xué)顯微鏡與化合物的熒光染料發(fā)射相結(jié)合的一種顯微觀察模式。在生物學(xué)中使用的多數(shù)熒光顯微鏡為落射熒光顯微鏡。

熒光顯微鏡的組件

光源（氙氣燈或水銀弧光燈）：水銀弧光燈發(fā)出的光比大多數(shù)白熾燈亮 10-100 倍，并提供從紫外線到紅外線的各種波長的光。

激發(fā)濾光片：激發(fā)濾光片的目的是濾除光源的所有波長，被檢熒光團(tuán)的激發(fā)范圍除外。圖像的亮度和亮度由濾光片的*小透射百分比決定。理想的透射率> 85%。

分色鏡（分束器）：分色鏡或分束器以 45° 角放置在激發(fā)濾光片和發(fā)射濾光片之間。二向色濾光片的功能是將激發(fā)信號反射到熒光團(tuán)，并將發(fā)射信號傳輸?shù)綑z測器。

發(fā)射濾光片：發(fā)射濾光片位于熒光顯微鏡的成像路徑內(nèi)。它的工作是過濾掉整個(gè)激發(fā)范圍并傳輸被檢查熒光團(tuán)的發(fā)射范圍。

物鏡：物鏡的目的是將光傳輸?shù)綐悠飞弦研纬蓤D像。光在到達(dá)物鏡之前穿過分色鏡。

攝像系統(tǒng)：攝像系統(tǒng)有助于以高分辨率記錄標(biāo)本的圖像。系統(tǒng)中經(jīng)常使用CCD（電荷耦合器件）相機(jī)。這些電子倍增相機(jī)擅長在不損失靈敏度的情況下對單光子事件進(jìn)行成像。它們不需要圖像增強(qiáng)器，并且可以高速捕獲圖像。